Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubqln4Q99NB8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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