Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms