Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col25a1Q99MQ5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms