Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms