Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms