Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms