Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms