Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pagr1aQ99L02 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms