Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms