Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn1Q99JR1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn1Q99JR1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms