Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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