Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6cQ91ZQ1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms