Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usb1Q91W78 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usb1Q91W78 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usb1Q91W78 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usb1Q91W78 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms