Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms