Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms