Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms