Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms