Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fyco1Q8VDC1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fyco1Q8VDC1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms