Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc28Q8VCE1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc28Q8VCE1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc28Q8VCE1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc28Q8VCE1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms