Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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