Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp45Q8K387 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp45Q8K387 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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