Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms