Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms