Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwnkQ8CIW5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms