Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms