Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps37aQ8CHS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms