Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rp1l1Q8CGM2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rp1l1Q8CGM2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rp1l1Q8CGM2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rp1l1Q8CGM2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rp1l1Q8CGM2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1l1Q8CGM2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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