Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc3Q8CFZ4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms