Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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