Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CC96 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CC96 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Q8CC96 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CC96 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CC96 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CC96 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CC96 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CC96 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms