Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms