Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubqln3Q8C5U9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms