Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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