Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4X2

Csnk1g3, Casein kinase I isoform gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1g3Q8C4X2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Csnk1g3Q8C4X2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Csnk1g3Q8C4X2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk1g3Q8C4X2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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