Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms