Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms