Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp398Q8BV16 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp398Q8BV16 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zfp398Q8BV16 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zfp398Q8BV16 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zfp398Q8BV16 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp398Q8BV16 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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