Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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