Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrp12Q8BUJ9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrp12Q8BUJ9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms