Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms