Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms