Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18a2Q8BRU6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc18a2Q8BRU6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms