Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem87bQ8BKU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms