Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms