Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ1

Hpcal4, Hippocalcin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal4Q8BGZ1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpcal4Q8BGZ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms