Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGN9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGN9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGN9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms