Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BGC1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms