Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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