Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem39bQ810L4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem39bQ810L4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms