Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Amigo1Q80ZD8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Amigo1Q80ZD8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo1Q80ZD8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo1Q80ZD8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo1Q80ZD8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo1Q80ZD8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo1Q80ZD8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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